Anthropic、Claudeが見つけた酵素系「ART」の初期結果を公表　約950のエージェントがDNA配列を探索、主な機能は研究中

候補探しはClaudeのエージェント、実験は人間が担う

Anthropicによると、同社の研究者が関わったのは最初のプロンプト（指示）と研究室での作業だけでした。指示は、DNA配列の大規模なデータベースから逆転写酵素（RT）の興味深い新しい例を探すというものでした。RTは、RNAをDNAに写し取る酵素です。

Claudeのエージェントはデータベースを調べ、RTのファミリーごとに分析しました。興味深い候補は、エージェントが自らの判断で選んだとしています。

探索には約950のエージェントが21時間を費やしました。使ったトークンは2億1000万です。

エージェントは20万を超えるRTを集め、新しい候補系を3,500選び出しました。そこから最も有力な20候補に絞り、人が読める報告書にまとめたと同社は説明しています。

約950のエージェントのうち1つが、変わった形のRTの遺伝子の隣で、DNA配列が繰り返し現れるパターンに気づきました。このエージェントは反復の数を数えて間隔を測り、既知のRTの系と配置を比べました。文献に同じパターンの報告がないかも調べ、人によるレビューに向けて報告書を出したとしています。

追加の分析と研究室での検証を経て、同社はこのパターンが、バクテリオファージ（細菌に感染するウイルス）にある未解明の酵素系の目印だと判断しました。

同社によると、研究室での作業はすべて人間の科学者が行っています。研究はバイオセーフティーレベルの低いBSL-1とBSL-2に限り、人に感染する病原体は扱いません。

ARTはCRISPRに似た反復配列を持ち、主な機能は研究中

同社によると、ART（array-associated reverse transcriptases）は主にバクテリオファージに見られ、3つの部分からなります。RT、隣接するパートナー遺伝子、等間隔に並ぶ反復DNA配列の長いアレイ（並び）です。

この反復配列の並び方は、CRISPRアレイに似ています。CRISPRアレイが蓄える異なるRNA配列は、CRISPR-Cas系をプログラム可能なバイオ技術の道具にしていると同社は説明しています。

同社によると、ARTが持つ特徴の組み合わせは、これまで少数のほかの系でしか見つかっていません。それらの系はいずれもプログラム可能で、DNAの切断、複製、貼り付けなどを行います。

同社の最初の実験では、ARTのアレイも、異なる短いRNAの組として発現していました。同社は、ARTでも似た仕組みが働いている可能性を示す結果としています。

同社によると、ARTのもとになるRTはジャンボファージで見つかったもので、過去の研究ですでに特定されていました。ARTを特徴づける要素は、タンパク質をコードしない（非コード）DNA配列のアレイと、機能不明の付属タンパク質の2つです。この2つの要素に初めて気づいたのはClaudeとみられる、と同社は説明しています。

同社によると、ARTの主な機能を調べる研究は続いており、仕組みを確かめる実験も進んでいます。同社はより詳しい内容をプレプリントと技術報告書で公開しています。